Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxa13Q62424 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms