Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm44725-201ENSMUST00000205307 391 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm39094-202ENSMUST00000206679 624 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Cyb5r2-202ENSMUST00000208217 1178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm45619-201ENSMUST00000210360 528 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm45866-201ENSMUST00000212425 326 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 AC137117.3-201ENSMUST00000226265 485 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 AC113031.6-202ENSMUST00000228468 1145 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm8849-201ENSMUST00000058951 480 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Zcwpw2-201ENSMUST00000111769 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm9430-201ENSMUST00000121232 1527 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm45629-201ENSMUST00000209629 2546 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Arsg-203ENSMUST00000106697 3232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Slc13a1-201ENSMUST00000031713 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Slc24a2-201ENSMUST00000044990 2218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Nnt-202ENSMUST00000099149 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Pttg1-204ENSMUST00000117446 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm21188-203ENSMUST00000224713 1669 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Zbtb26-202ENSMUST00000102789 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Cyp2j9-201ENSMUST00000055693 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 4930543E12Rik-202ENSMUST00000210408 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Fam90a1a-201ENSMUST00000110741 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Tpd52l2-208ENSMUST00000149163 3603 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Arhgap17-204ENSMUST00000205262 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm35106-201ENSMUST00000192731 250 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm29154-206ENSMUST00000213410 1180 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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