Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Olfr5-201ENSMUST00000086318 1044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Olfr1491-202ENSMUST00000214007 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Olfr1491-203ENSMUST00000215493 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Olfr1491-205ENSMUST00000216377 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm26612-201ENSMUST00000180785 1055 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm32710-201ENSMUST00000210677 618 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Yipf3Q3UDR8 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms