Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Trpm6-201ENSMUST00000040489 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
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Ctdnep1Q3TP92 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
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Ctdnep1Q3TP92 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms