Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
H2afvQ3THW5 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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