Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Top2aQ01320 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms