Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Ighv2-4-201ENSMUST00000103447 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Ighv1-55-201ENSMUST00000103526 415 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm24335-201ENSMUST00000104211 132 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Crem-209ENSMUST00000129435 1160 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm13536-201ENSMUST00000132913 766 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm24004-201ENSMUST00000158460 178 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 6530403H02Rik-201ENSMUST00000182099 402 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm7734-201ENSMUST00000182832 1011 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 1700081B01Rik-202ENSMUST00000197543 648 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm5857-201ENSMUST00000198953 493 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Iglc1-201ENSMUST00000200568 454 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Dppa5b-201ENSMUST00000214261 348 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Dppa5c-201ENSMUST00000216268 348 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 AC211878.7-201ENSMUST00000222851 661 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 AC134577.2-201ENSMUST00000228541 715 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Abhd3-201ENSMUST00000002549 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr978-201ENSMUST00000057161 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Svs3b-201ENSMUST00000063132 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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VdrP48281 Olfr17-201ENSMUST00000098138 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Defa28-201ENSMUST00000098887 400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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VdrP48281 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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VdrP48281 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 AC132467.1-201ENSMUST00000226498 1845 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VdrP48281 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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VdrP48281 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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VdrP48281 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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VdrP48281 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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VdrP48281 Babam2-203ENSMUST00000114507 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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VdrP48281 Gm12206-201ENSMUST00000119795 601 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 1700003M07Rik-201ENSMUST00000139884 541 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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VdrP48281 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm17572-201ENSMUST00000171455 420 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm18828-201ENSMUST00000180475 857 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm43310-201ENSMUST00000198975 820 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VdrP48281 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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