Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Olfr1426-206ENSMUST00000219996 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Nbr1-202ENSMUST00000103098 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Kpna3-201ENSMUST00000022496 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Chd1P40201 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms