Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Olfr117-203ENSMUST00000215414 3498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Cat-201ENSMUST00000028610 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Cga-202ENSMUST00000108130 609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm15849-201ENSMUST00000159257 335 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm18301-201ENSMUST00000185261 888 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm38242-201ENSMUST00000192354 430 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm32569-201ENSMUST00000193955 604 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm40040-201ENSMUST00000196123 504 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm42429-201ENSMUST00000198579 558 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm36849-201ENSMUST00000210345 680 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Klf6-201ENSMUST00000000080 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Srgap1-202ENSMUST00000081688 7787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Slc39a9-201ENSMUST00000085245 5201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm26896-201ENSMUST00000180482 2526 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm28485-201ENSMUST00000185300 1500 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm28684-201ENSMUST00000185586 1500 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm28422-201ENSMUST00000186112 1500 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm29447-201ENSMUST00000186407 1500 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm29628-201ENSMUST00000187206 1500 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm28316-201ENSMUST00000187576 1500 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm29313-201ENSMUST00000187866 1500 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm28252-201ENSMUST00000188457 1500 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm28950-203ENSMUST00000188826 1500 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm29303-201ENSMUST00000189215 1500 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm28220-201ENSMUST00000189607 1500 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm29342-202ENSMUST00000189689 1500 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm29116-202ENSMUST00000189963 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm29081-203ENSMUST00000190140 1500 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm28726-201ENSMUST00000190994 1500 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm29386-203ENSMUST00000191185 1500 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm33954-202ENSMUST00000195188 1500 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Creb1-202ENSMUST00000087366 8364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 9430073C21Rik-201ENSMUST00000145346 2173 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC136986.2-201ENSMUST00000220880 2944 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Lrrc32-201ENSMUST00000165205 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Vrk1-203ENSMUST00000085026 3711 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Ccdc77-201ENSMUST00000032283 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Cphx2-201ENSMUST00000168149 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm12517-201ENSMUST00000122082 425 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 U2af1l4-205ENSMUST00000163482 668 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms