Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 Serping1-201ENSMUST00000023994 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sptan1P16546 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Vmn2r8-201ENSMUST00000172140 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm43836-201ENSMUST00000196532 381 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm42634-201ENSMUST00000197362 381 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Idi2-201ENSMUST00000038598 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Cacng5-202ENSMUST00000106742 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gm43071-201ENSMUST00000197233 2032 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Sptan1P16546 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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