Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Fam166b-202ENSMUST00000107928 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Scgb2b4-ps-201ENSMUST00000186705 340 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm28244-201ENSMUST00000189342 356 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Cinp-205ENSMUST00000221182 774 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 AC165157.2-201ENSMUST00000222265 367 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gzma-202ENSMUST00000224282 996 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 n-R5s74-201ENSMUST00000082654 116 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm26209-201ENSMUST00000103852 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm25607-201ENSMUST00000104020 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm15753-201ENSMUST00000119241 1062 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Bdh2-202ENSMUST00000120397 1172 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 5830468F06Rik-201ENSMUST00000184288 1104 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm5037-201ENSMUST00000205327 618 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 Gm12691-202ENSMUST00000222516 918 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Smim18J3QNP2 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms