Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
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Tmf1B9EKI3 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmf1B9EKI3 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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