Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr1303-201ENSMUST00000099609 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 1700074P13Rik-202ENSMUST00000122181 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 A330076C08Rik-202ENSMUST00000223513 1937 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr152-203ENSMUST00000215394 2172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 D7Ertd443e-203ENSMUST00000172947 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm28444-201ENSMUST00000190777 2137 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Parp9-201ENSMUST00000023622 2973 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm9392-201ENSMUST00000119337 554 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm13218-201ENSMUST00000128180 265 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Rpl21-ps8-201ENSMUST00000130005 478 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Med6-204ENSMUST00000161211 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm8065-201ENSMUST00000164048 605 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm27224-201ENSMUST00000184749 564 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm29577-201ENSMUST00000186427 693 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 1700008B11Rik-201ENSMUST00000198145 634 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Spa17-201ENSMUST00000002013 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm34304-201ENSMUST00000218927 1139 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm33682-201ENSMUST00000222233 256 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Ly6f-201ENSMUST00000023247 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr412-201ENSMUST00000077794 939 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr298-201ENSMUST00000077800 999 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms