Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm43809-201ENSMUST00000200694 338 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Olfr665-201ENSMUST00000098165 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms