Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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