Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11295-201ENSMUST00000121379 803 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms