Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Nhlrc3Q8CCH2 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms