Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Actn1Q7TPR4 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms