Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Cyp4a30-ps-201ENSMUST00000120813 1020 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Gm15324-201ENSMUST00000139397 355 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Gm2564-201ENSMUST00000166898 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Gm26612-201ENSMUST00000180785 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Vmn1r37-206ENSMUST00000228791 1617 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Gm11690-201ENSMUST00000128183 1856 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Fam45a-201ENSMUST00000025957 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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Znf48Q3US17 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Znf48Q3US17 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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