Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
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Usp39Q3TIX9 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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