Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Ebf1Q07802 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Ebf1Q07802 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Ebf1Q07802 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Ebf1Q07802 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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