Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cux1P53564 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cux1P53564 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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