Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpl28P41105 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms