Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Olfr1276-203ENSMUST00000218065 5052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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