Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Chd7-202ENSMUST00000051558 10216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Cndp1-201ENSMUST00000070139 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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PtprmP28828 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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PtprmP28828 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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PtprmP28828 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprmP28828 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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PtprmP28828 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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PtprmP28828 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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PtprmP28828 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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PtprmP28828 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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PtprmP28828 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
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PtprmP28828 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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PtprmP28828 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprmP28828 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
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