Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChgaP26339 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ChgaP26339 Gm42538-202ENSMUST00000199431 358 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChgaP26339 Zim2-202ENSMUST00000203572 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChgaP26339 Chn2-214ENSMUST00000204746 825 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChgaP26339 Gm7546-202ENSMUST00000211354 275 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ChgaP26339 Thy1-204ENSMUST00000214627 446 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChgaP26339 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChgaP26339 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ChgaP26339 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChgaP26339 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ChgaP26339 Gm14267-205ENSMUST00000226697 1299 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ChgaP26339 Olfr214-201ENSMUST00000060204 1008 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChgaP26339 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChgaP26339 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ChgaP26339 n-R5s92-201ENSMUST00000082810 119 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
ChgaP26339 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ChgaP26339 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Glod4-209ENSMUST00000170710 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChgaP26339 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChgaP26339 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 n-R5s2-201ENSMUST00000101968 119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm22369-201ENSMUST00000102415 104 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 n-R5s194-201ENSMUST00000104719 119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm7910-201ENSMUST00000117896 835 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm11520-201ENSMUST00000122837 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Nhej1-201ENSMUST00000152855 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Tmcc1-209ENSMUST00000173548 1622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 n-R5s112-201ENSMUST00000178208 119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 n-R5s125-201ENSMUST00000179377 119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 n-R5s120-201ENSMUST00000180000 119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm1988-201ENSMUST00000188190 2565 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm28476-201ENSMUST00000190540 696 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm42402-201ENSMUST00000208341 1054 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm29154-249ENSMUST00000217020 847 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Hsd17b3-204ENSMUST00000222783 1184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 AC125350.5-201ENSMUST00000226102 517 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 3110009E18Rik-202ENSMUST00000056038 401 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Olfr418-201ENSMUST00000059754 991 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm11567-201ENSMUST00000078442 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Insl5-201ENSMUST00000084382 695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 n-R5s33-201ENSMUST00000093713 119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
ChgaP26339 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms