Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 B020031H02Rik-201ENSMUST00000209977 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Stambp-201ENSMUST00000068054 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 AC163342.1-201ENSMUST00000216533 2718 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Nsun3-201ENSMUST00000063089 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Adgrl3-209ENSMUST00000119385 4905 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Cass4-203ENSMUST00000109136 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm38251-201ENSMUST00000192968 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Zfp677-202ENSMUST00000162659 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm15533-202ENSMUST00000206216 3262 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Tmem268-202ENSMUST00000080336 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm24327-201ENSMUST00000175108 78 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Nudt13-201ENSMUST00000022343 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Slc2a9-210ENSMUST00000155634 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Gm44937-201ENSMUST00000207705 2691 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Orc1-201ENSMUST00000102744 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Xpo7-206ENSMUST00000228346 4491 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Bbs9-211ENSMUST00000150395 3425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 9130214F15Rik-201ENSMUST00000208727 1653 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Faf2-203ENSMUST00000126071 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 A830010M20Rik-201ENSMUST00000060553 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prim1P20664 Synj1-210ENSMUST00000170853 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.9 ms