Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 A230009B12Rik-201ENSMUST00000159422 898 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm45323-201ENSMUST00000209853 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 AC155269.1-201ENSMUST00000220843 769 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 8030411F24Rik-201ENSMUST00000028933 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Ralgps2-201ENSMUST00000027886 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 4930466I24Rik-201ENSMUST00000144105 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Crb1-202ENSMUST00000196402 2711 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Nxpe4-202ENSMUST00000215780 2875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm9392-201ENSMUST00000119337 554 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm11730-202ENSMUST00000147186 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm20918-201ENSMUST00000179629 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm26726-201ENSMUST00000181889 395 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm29142-201ENSMUST00000188009 696 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm28508-201ENSMUST00000188016 696 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 4930512B01Rik-202ENSMUST00000188608 983 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm38033-201ENSMUST00000192037 269 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm37623-201ENSMUST00000193691 803 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gabra4-203ENSMUST00000198138 440 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PdgfaP20033 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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