Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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H2-Eb1P04230 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
H2-Eb1P04230 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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