Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms