Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Taf4bG5E8Z2 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Taf4bG5E8Z2 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Taf4bG5E8Z2 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Taf4bG5E8Z2 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Taf4bG5E8Z2 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Taf4bG5E8Z2 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Taf4bG5E8Z2 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Taf4bG5E8Z2 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Taf4bG5E8Z2 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Taf4bG5E8Z2 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Taf4bG5E8Z2 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Taf4bG5E8Z2 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Taf4bG5E8Z2 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Taf4bG5E8Z2 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms