Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usf3B2RUQ2 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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