Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Sept3-201ENSMUST00000023095 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprbB2RU80 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms