Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm45274-201ENSMUST00000209938 647 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm42899-201ENSMUST00000197034 2667 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Neurod1-201ENSMUST00000041099 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 D3Ertd751e-208ENSMUST00000192193 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm13682-201ENSMUST00000117524 702 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr1381-201ENSMUST00000167248 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
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Rabgef1Q9JM13 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
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Rabgef1Q9JM13 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC123058.1-201ENSMUST00000223748 437 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Rabgef1Q9JM13 Fabp5l2-201ENSMUST00000072582 408 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
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