Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rnf6Q9DBU5 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rnf6Q9DBU5 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rnf6Q9DBU5 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rnf6Q9DBU5 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rnf6Q9DBU5 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rnf6Q9DBU5 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rnf6Q9DBU5 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Rnf6Q9DBU5 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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