Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Med27Q9DB40 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms