Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
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