Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Cndp1-201ENSMUST00000070139 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm44437-201ENSMUST00000203832 4038 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Zswim9-202ENSMUST00000119139 3986 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Akap1-202ENSMUST00000107903 3721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms