Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms