Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AC133189.3-201ENSMUST00000226269 878 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm10490-201ENSMUST00000086274 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm12861-201ENSMUST00000145395 681 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm43647-201ENSMUST00000198142 486 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 4933439J24Rik-201ENSMUST00000200866 853 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Cst7-201ENSMUST00000089200 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 Gm11765-201ENSMUST00000121173 1205 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CtifQ6PEE2 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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