Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Krtap7-1-201ENSMUST00000056118 620 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr466-201ENSMUST00000058907 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Tex28-201ENSMUST00000078060 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm8818-201ENSMUST00000110797 1047 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm44588-201ENSMUST00000208401 545 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC154640.1-204ENSMUST00000227105 648 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Folr2-201ENSMUST00000094141 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms