Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms