Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Ttc39dQ0VF76 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Ttc39dQ0VF76 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Ttc39dQ0VF76 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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Ttc39dQ0VF76 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Ttc39dQ0VF76 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Ttc39dQ0VF76 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Ttc39dQ0VF76 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Ttc39dQ0VF76 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Ttc39dQ0VF76 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Ttc39dQ0VF76 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ttc39dQ0VF76 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms