Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ufm1P61961 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms