Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
P58686 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
P58686 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
P58686 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
P58686 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
P58686 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
P58686 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
P58686 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
P58686 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
P58686 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
P58686 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
P58686 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
P58686 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gm18339-201ENSMUST00000218074 888 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 AC126939.2-201ENSMUST00000225989 307 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P58686 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Krt39-201ENSMUST00000076948 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Gm24542-201ENSMUST00000103870 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Gm11763-201ENSMUST00000119964 312 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Gm16077-201ENSMUST00000121915 655 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P58686 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms