Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PctpP53808 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PctpP53808 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PctpP53808 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PctpP53808 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm30382-202ENSMUST00000199007 1801 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PctpP53808 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PctpP53808 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PctpP53808 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PctpP53808 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PctpP53808 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PctpP53808 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PctpP53808 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PctpP53808 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PctpP53808 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PctpP53808 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PctpP53808 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PctpP53808 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PctpP53808 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PctpP53808 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PctpP53808 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms