Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Olfr63-203ENSMUST00000217023 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Ank2-201ENSMUST00000044443 5775 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Pcdhb11-201ENSMUST00000053073 4419 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprkP35822 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Smpd4-203ENSMUST00000090159 4565 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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