Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Hoxc11P31313 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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