Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pabpc1P29341 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms