Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RhoP15409 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RhoP15409 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RhoP15409 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RhoP15409 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RhoP15409 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms